El Suzuki DF250AP está propulsado por un motor DOHC de 6 cilindros y 4.028 cc con 4 válvulas por cilindro. Está equipado con un eje de transmisión desplazado con respecto al cigüeñal, lo que permite una primera reducción entre el cigüeñal y el eje de transmisión y una segunda reducción entre el eje de transmisión y la caja de cambios en el interior del pie. Este mecanismo permite montar hélices de gran diámetro para aprovechar al máximo la eficiencia propulsora del motor. También mueve el centro de gravedad hacia adelante, dando al motor un mayor equilibrio, menos vibraciones y mayor estabilidad durante la conducción.

Múltiples motores requieren motores con rotaciones opuestas para cancelar la deriva causada por la rotación de la hélice. El DF250AP cuenta con el sistema Suzuki Selective Rotation, que cuenta con un pie especial “selectivo” capaz de girar la hélice hacia la izquierda o hacia la derecha según sea necesario sin alterar su eficiencia. Para obtener la versión contrarrotatoria basta con sustituir un conector en el cableado del motor y la adopción de una hélice adecuada.